Katedra Patofizjologii prowadzi działalność naukowo-badawcza oraz realizuje programy dydaktyczne z zakresu Patofizjologii dla studentów polskich i obcokrajowców Wydziału Lekarskiego i Oddziału Stomatologii, Wydziału Farmacji i Oddziału Analityki Medycznej, Wydziału Ochrony Zdrowia CM UJ.

Pracownie Katedry są wyposażone w nowoczesną aparaturę medyczną renomowanych firm krajowych i zagranicznych umożliwiającą wykonywanie szerokiego zakresu badań dla celów diagnostycznych oraz naukowo-badawczych.

Główne kierunki działalności naukowo-badawczej to neurogastroenterologia i aktywność układu autonomicznego. Badania kliniczne roli układu autonomicznego w patogenezie chorób przewodu pokarmowego i serca. Badania doświadczalne dotyczą czucia trzewnego i jego transmisji.

Zaburzenia aktywności układu autonomicznego są także przedmiotem zajęć fakultatywnych dla studentów Wydziału Lekarskiego i Farmacji.

W pracach naukowych aktywnie uczestniczą studenci działającego w Katedrze Studenckiego Koła Naukowego a także studenci Wydziału Farmacji wykonujący prace magisterskie.

Dynamicznie rozwijająca się działalność naukowa znacznie podnosi kwalifikacje całej kadry naukowej poprzez:

• Nieustanne poszerzanie wiedzy i doświadczenia w pracach naukowo-badawczych
• Publikowanie prac naukowych w czasopismach krajowych i zagranicznych
• Współautorstwo w podręcznikach głównie z zakresu kardiologii oraz gastroenterologii i chirurgii przewodu pokarmowego
• Udział w zjazdach i konferencjach naukowych w kraju i za granicą
• Nawiązywanie współpracy z innymi jednostkami w kraju i za granicą. (patrz: współpraca.doc)
• Wyjazdy na stypendia do renomowanych ośrodków zagranicznych (Belgia, Niemcy, USA)
• Zdobywanie kolejnych stopni naukowych (w ciągu ostatnich 5 lat w Katedrze prace doktorskie broniło sześciu asystentów i trzech słuchaczy studiów doktoranckich a 5 studentów Farmacji wykonało prace magisterskie)